على الرغم من ندرة الاستخدام الجراحى حاليا لتخلص من مشكلة الشخير إلا أنه يمكن اللجوء إليها فى الحالات القصوى، وخاصة عند فشل الطرق العلاجية الدوائية وأكد الدكتور محمد فتحى اخصائى الجراحة العامة إن الهدف من الجراحة فى تلك الحالة هوتوسيع مجرى التنفس العلوى، لذلك يتم استئصال اللوزتين والزوائد الأنفية أوما يعرف باسم اللحمية.
أو قد تتم الجراحة بهدف تعديل البناء العظمى المحيط بمجرى التنفس لتوسعيه وجعل عملية التنفس تتم بسهولة ولكن يجب الحذر من عدة عوامل فالمريض الذى سيجرى جراحة من أجل التخلص من الشخير يجب أن يمر باختبار ما يسمى بدراسة النوم.
ويجب على المريض أن يتأكد من أن سبب الشخير ناتج عن مشكلة تتعلق بالفك الأعلى، كما يجب أن يكون المريض قد حاول العلاج الدوائى أولا قبل أن يدخل غرفة العمليات.
وعلى المريض الذى سيجرى جراحة متعلقة بالشخير أن يتمتع بعده عوامل منها أن يتمتع بوزن مناسب وان ﻻ يكون بدينا أوأن يكون مدمنا على تناول الكحول وأن لا يكون قد خضع لعملية استئصال اللوزتين سابقا.